MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfurovum sp. NBC37-1 chromosome

Total Repeats: 46547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009663	GAAT	2	8	63	70	50 %	25 %	25 %	0 %	152991598
2	NC_009663	A	6	6	98	103	100 %	0 %	0 %	0 %	152991598
3	NC_009663	TA	3	6	131	136	50 %	50 %	0 %	0 %	152991598
4	NC_009663	A	7	7	136	142	100 %	0 %	0 %	0 %	152991598
5	NC_009663	CAAA	2	8	334	341	75 %	0 %	0 %	25 %	152991598
6	NC_009663	ACC	2	6	434	439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152991598
7	NC_009663	AG	3	6	641	646	50 %	0 %	50 %	0 %	152991598
8	NC_009663	CTG	3	9	665	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991598
9	NC_009663	GAC	2	6	677	682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991598
10	NC_009663	CAG	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991598
11	NC_009663	AGG	2	6	714	719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152991598
12	NC_009663	CAA	2	6	754	759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152991598
13	NC_009663	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152991598
14	NC_009663	CAT	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991598
15	NC_009663	A	6	6	896	901	100 %	0 %	0 %	0 %	152991598
16	NC_009663	CT	3	6	1008	1013	0 %	50 %	0 %	50 %	152991598
17	NC_009663	A	6	6	1082	1087	100 %	0 %	0 %	0 %	152991598
18	NC_009663	GAT	2	6	1103	1108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991598
19	NC_009663	ATCAA	2	10	1154	1163	60 %	20 %	0 %	20 %	152991598
20	NC_009663	A	7	7	1162	1168	100 %	0 %	0 %	0 %	152991598
21	NC_009663	CCATG	2	10	1288	1297	20 %	20 %	20 %	40 %	152991598
22	NC_009663	CAAA	2	8	1359	1366	75 %	0 %	0 %	25 %	152991598
23	NC_009663	ATC	2	6	1608	1613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
24	NC_009663	TCA	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
25	NC_009663	T	6	6	1640	1645	0 %	100 %	0 %	0 %	152991599
26	NC_009663	A	8	8	1648	1655	100 %	0 %	0 %	0 %	152991599
27	NC_009663	CA	3	6	1675	1680	50 %	0 %	0 %	50 %	152991599
28	NC_009663	TTCTC	2	10	1686	1695	0 %	60 %	0 %	40 %	152991599
29	NC_009663	A	6	6	1800	1805	100 %	0 %	0 %	0 %	152991599
30	NC_009663	ATC	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
31	NC_009663	ATC	2	6	1842	1847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
32	NC_009663	TATCAA	2	12	2057	2068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152991599
33	NC_009663	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991599
34	NC_009663	ACA	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152991599
35	NC_009663	GAA	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991599
36	NC_009663	A	6	6	2166	2171	100 %	0 %	0 %	0 %	152991599
37	NC_009663	TAT	2	6	2217	2222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152991599
38	NC_009663	ATC	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
39	NC_009663	CTT	2	6	2258	2263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991599
40	NC_009663	ATC	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
41	NC_009663	A	6	6	2346	2351	100 %	0 %	0 %	0 %	152991599
42	NC_009663	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991599
43	NC_009663	TGAA	2	8	2491	2498	50 %	25 %	25 %	0 %	152991599
44	NC_009663	CT	3	6	2508	2513	0 %	50 %	0 %	50 %	152991599
45	NC_009663	CAG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991599
46	NC_009663	AT	3	6	2525	2530	50 %	50 %	0 %	0 %	152991599
47	NC_009663	CCTT	2	8	2591	2598	0 %	50 %	0 %	50 %	152991599
48	NC_009663	TCA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
49	NC_009663	ATC	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
50	NC_009663	A	6	6	2670	2675	100 %	0 %	0 %	0 %	152991600
51	NC_009663	CAA	2	6	2676	2681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152991600
52	NC_009663	AT	3	6	2683	2688	50 %	50 %	0 %	0 %	152991600
53	NC_009663	GCA	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991600
54	NC_009663	AG	3	6	2772	2777	50 %	0 %	50 %	0 %	152991600
55	NC_009663	AAC	3	9	2930	2938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152991600
56	NC_009663	TTG	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991600
57	NC_009663	GGT	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152991600
58	NC_009663	TTCCT	2	10	3123	3132	0 %	60 %	0 %	40 %	152991600
59	NC_009663	CTT	2	6	3197	3202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991600
60	NC_009663	TGC	2	6	3297	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991600
61	NC_009663	CAG	2	6	3319	3324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991600
62	NC_009663	GGA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152991600
63	NC_009663	GATG	2	8	3487	3494	25 %	25 %	50 %	0 %	152991600
64	NC_009663	ATC	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991600
65	NC_009663	AGA	2	6	3532	3537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991600
66	NC_009663	GCG	2	6	3683	3688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152991600
67	NC_009663	GCGTG	2	10	3739	3748	0 %	20 %	60 %	20 %	152991600
68	NC_009663	TGG	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152991600
69	NC_009663	ATCT	2	8	3911	3918	25 %	50 %	0 %	25 %	152991600
70	NC_009663	CGA	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991600
71	NC_009663	ATG	2	6	4047	4052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991600
72	NC_009663	GAT	2	6	4057	4062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991600
73	NC_009663	GA	3	6	4067	4072	50 %	0 %	50 %	0 %	152991600
74	NC_009663	AG	3	6	4106	4111	50 %	0 %	50 %	0 %	152991600
75	NC_009663	TC	3	6	4360	4365	0 %	50 %	0 %	50 %	152991601
76	NC_009663	AG	3	6	4445	4450	50 %	0 %	50 %	0 %	152991601
77	NC_009663	CAT	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991601
78	NC_009663	ACG	2	6	4496	4501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991601
79	NC_009663	TGA	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991601
80	NC_009663	T	7	7	4512	4518	0 %	100 %	0 %	0 %	152991601
81	NC_009663	CGA	2	6	4519	4524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991601
82	NC_009663	TC	3	6	4579	4584	0 %	50 %	0 %	50 %	152991601
83	NC_009663	ATT	2	6	4592	4597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152991601
84	NC_009663	AGA	2	6	4675	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991601
85	NC_009663	TAT	2	6	4744	4749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152991601
86	NC_009663	TCGCT	2	10	4821	4830	0 %	40 %	20 %	40 %	152991601
87	NC_009663	GAA	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991601
88	NC_009663	ATG	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991601
89	NC_009663	TGG	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152991601
90	NC_009663	AGC	2	6	4967	4972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991601
91	NC_009663	GAAG	2	8	5008	5015	50 %	0 %	50 %	0 %	152991601
92	NC_009663	GCC	2	6	5063	5068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991601
93	NC_009663	GGA	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152991601
94	NC_009663	ATC	2	6	5237	5242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991601
95	NC_009663	TTG	2	6	5280	5285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991601
96	NC_009663	AG	3	6	5489	5494	50 %	0 %	50 %	0 %	152991601
97	NC_009663	ACC	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152991601
98	NC_009663	GAT	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991601
99	NC_009663	TCA	2	6	5649	5654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991601
100	NC_009663	GCAG	2	8	5674	5681	25 %	0 %	50 %	25 %	152991601
101	NC_009663	AGG	2	6	5727	5732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152991601
102	NC_009663	GA	3	6	5784	5789	50 %	0 %	50 %	0 %	152991601
103	NC_009663	TGA	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991601
104	NC_009663	ATAAA	2	10	5859	5868	80 %	20 %	0 %	0 %	152991601
105	NC_009663	A	6	6	5884	5889	100 %	0 %	0 %	0 %	152991602
106	NC_009663	ACC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152991602
107	NC_009663	CA	3	6	5988	5993	50 %	0 %	0 %	50 %	152991602
108	NC_009663	CTG	2	6	6040	6045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991602
109	NC_009663	AGGT	2	8	6082	6089	25 %	25 %	50 %	0 %	152991602
110	NC_009663	TC	3	6	6266	6271	0 %	50 %	0 %	50 %	152991603
111	NC_009663	CCG	2	6	6304	6309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991603
112	NC_009663	TCT	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991603
113	NC_009663	ACC	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152991603
114	NC_009663	AGAT	2	8	6475	6482	50 %	25 %	25 %	0 %	152991603
115	NC_009663	CCG	2	6	6499	6504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991603
116	NC_009663	AG	3	6	6603	6608	50 %	0 %	50 %	0 %	152991603
117	NC_009663	CA	3	6	6626	6631	50 %	0 %	0 %	50 %	152991603
118	NC_009663	CCT	2	6	6638	6643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152991603
119	NC_009663	T	6	6	6687	6692	0 %	100 %	0 %	0 %	152991603
120	NC_009663	GT	3	6	6755	6760	0 %	50 %	50 %	0 %	152991603
121	NC_009663	TCA	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991603
122	NC_009663	AGA	2	6	6846	6851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991603
123	NC_009663	TGTC	2	8	6902	6909	0 %	50 %	25 %	25 %	152991603
124	NC_009663	CGC	2	6	6944	6949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991603
125	NC_009663	TCC	2	6	7006	7011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152991603
126	NC_009663	GTT	2	6	7035	7040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991603
127	NC_009663	ATG	2	6	7190	7195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991604
128	NC_009663	TTC	2	6	7301	7306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991604
129	NC_009663	CGT	2	6	7310	7315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991604
130	NC_009663	TG	4	8	7343	7350	0 %	50 %	50 %	0 %	152991604
131	NC_009663	T	6	6	7516	7521	0 %	100 %	0 %	0 %	152991604
132	NC_009663	AGC	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991604
133	NC_009663	TC	3	6	7578	7583	0 %	50 %	0 %	50 %	152991604
134	NC_009663	TC	3	6	7585	7590	0 %	50 %	0 %	50 %	152991604
135	NC_009663	CGA	2	6	7651	7656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991604
136	NC_009663	CCG	2	6	7704	7709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991604
137	NC_009663	T	6	6	7736	7741	0 %	100 %	0 %	0 %	152991604
138	NC_009663	TG	3	6	7780	7785	0 %	50 %	50 %	0 %	152991604
139	NC_009663	TC	3	6	7891	7896	0 %	50 %	0 %	50 %	152991604
140	NC_009663	TC	3	6	7980	7985	0 %	50 %	0 %	50 %	152991604
141	NC_009663	GAT	2	6	8000	8005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991604
142	NC_009663	GAT	3	9	8099	8107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991604
143	NC_009663	TTC	3	9	8112	8120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991604
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146	NC_009663	CGA	2	6	8350	8355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991604
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172	NC_009663	CTT	2	6	9644	9649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991606
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259	NC_009663	GCC	2	6	14357	14362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991611
260	NC_009663	CAT	2	6	14457	14462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991611
261	NC_009663	GGA	2	6	14487	14492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152991611
262	NC_009663	T	7	7	14545	14551	0 %	100 %	0 %	0 %	152991611
263	NC_009663	AAG	2	6	14613	14618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991611
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265	NC_009663	CTT	2	6	14706	14711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991611
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389	NC_009663	A	6	6	22186	22191	100 %	0 %	0 %	0 %	152991620
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